Geldim, gideceğim..

Son girişten bu yana 20 gün geçmiş. Bu sürede ben bir kore filmi misali, olabilecek her türlü heyecanı yaşadım, duyguyu tattım. Sizlere bu kanaldan söylemediğim üzere, 1 Haziran’da, doktora sonrası çalışmalarda bulunmak üzere başvurduğum yerlerden biri olan Hollanda’daki Delft Teknoloji Üniversitesi (TUDelft) tarafından görüşme için çağrılmıştım. Hollanda’nın en büyük üniversitesi olan TUDelft, bünyesinde birçok Nobel’li amcayı da barındırmakta. Amsterdam’dan bindiğim trenden inip, Delft’e adım attığım anda, o ana değin bulunduğum en güzel coğrafya parçasında olduğuma kanaat getirdim: Dört bir yandan kelebek misali geliveren üçlü dörtlü bisikletçi grupları, içinde nilüferler açmış kanallar, parke taşlarından (arnavut kaldırımı mı deniyordu yoksa bunlara?) yollar, Oz büyücüsüne giden Dorothy misali ben de bir an donakaldım. Orada iken çektiğim resimleri galeriye koydum. Sonrasında iki gün boyunca yoğun mülakatların ardından, cuma gecesi 1 gibi Ankara’ya iniş yaptık. Orada iken, bir hafta içerisinde sonucu bildireceklerini söylemişlerdi – ben de gitmeden evvel “büyük bir ihtimalle döndüğümde az çok nasıl neticeleneceği hakkında bir fikre sahip olurum” diyorduysam da, döndüğümde, durum tam ortadaydı. Salı akşamı oradaki müstakbel hocam Dr. Sluiter’dan bir eposta aldım, sevgili “hocam” beni telefonla aramış fakat ulaşamayınca posta göndermiş. Onun bizim saatimizle 17.30 civarında gönderdiği bu postayı benim görmem, Ece’yi yedirip, yıkayıp, yatırdıktan sonra, yani yaklaşık 21.15 sularında gerçekleşti. Neyse, lafı daha fazla uzatmadan, sadede gelirsek, çok şükür, TUDelft’e kabul edilmiştim. Hayli fazla imkana sahip olan bu güzel üniversitede ayrıca çalışacağım grup da çok iyi, her şey rüya gibi… Salı akşamından beri vur patlasın, çal oynasın durumları kısaca.

Sayın Felegin Sillesini Yemiş Acıların Kadını beni uyarmasaydı, bu müjdeli haberi bildirmeyi ne kadar zaman daha akıl edemezdim, kim bilir..

Bir de: Fiziksel, CVsel, ve ingliş bir kardeş blogum oldu. Delft’ten dönüşümde, hazır Sevgili Nur Hoca için yazdığım / tasarladığım sayfa kodunu hemen kendime uyarlayıp, artık bir ihtiyaç haline gelmiş bulunan Mostly Scientific Personal Home Page‘imi siber uzayda gerçekledim (bkz. Sanal Uzay ve Gerçeklemek).

İşaret?

Evet, uğuru kaçmasın diye postdoc maceralarımla ilgili buraları pek bilgilendirmiyorum ama böylesi bir haberle karşılaşınca da, alıntılamadan edemedim.. Hayırlısı diyelim…

TU Delft signs partnership agreement with top Turkish university
10 April 2007 by M&C

Press release – Delft University of Technology and the Middle East Technical University (Ankara) will sign a Memorandum of Understanding on Thursday April 12, formalising agreements about the development of a joint curriculum at the Master’s level, joint PhD studentships and joint research programmes.

The Middle East Technical University (METU) is located in the Turkish capital of Ankara. It has worked with TU Delft on education and research for some years. This collaboration was first formalised in 2004, in an agreement at institutional level. Since then a number of concrete initiatives have been developed to give further form to cooperation in education and research. The two universities now wish to refine their collaborative venture still further, to include specific initiatives in which both institutions regard each other as preferred partners.

METU’s chairman, Prof. Ural Akbulut, will visit TU Delft on Thursday 12 April to sign a Memorandum of Understanding. This document will lay out agreements for the development of joint curriculums at the Master’s level, joint PhD studentships and joint research programmes.

The agreement is in keeping with TU Delft’s aspirations to enter into long-term partnerships with leading technical universities in Turkey. One of its aims is to help boost the number of graduate engineers and technical-scientific lecturers in Turkey. Another is to help achieve the desired intake of science and technology students in the Netherlands.

…and then she started screaming: MIKE! MIKE!

Başlık, konuyla pek alakalı değil ama, Mike denince aklıma hep ST’nin Institutionalized‘ı gelir.

Efendim, Mike, Ph.D. Comics’in aylak elemanıdır. Yakın zamanda baba olmuştur. Ve, -söylememe gerek var mı bilmem ama- bu naçiz yazarınızın strip’de kendisini en çok eşleştirdiği kişisidir. Dün akşam şu strip’le karşılaşınca, neler hissettiğimi tahmin edebilirsiniz:

Time to End This / Ph.D. Comics, 02/23/2007

Haydi bakalım!..

Bugünün -şimdiye kadar olan kısmının- özeti:
Nazım sağolsun, sayesinde kavuştuğum züper bilgisayara (IBM BladeCenter H – 14 Intel Xeon Dual Core 3.00 GHz CPUs) haftasonu özenle hazırladığım 4 nanoçarkın kararlılığını test eden programı çalıştırdım. Birazdan yemeğe gideriz, sonrasında teze daha da bir girişeceğim. Bir de şu postdoc başvurularından haber çıksa!.. Sabah Şakir Hocam çağırdı, “acaba postdoc’lardan haber mi var?” diye heyecanla odasına gittim, meğer geçen sene hazırlanmasına biraz yardım ettiğim bir kitap için telif ücreti göndermişler, Şakir Hoca da bu ücretten payıma düşeni teslim etti..

HyperChem’de mutlu son

Dün, MM+ force field‘in en zorlu kısmı olan bağ enerjileri hesaplarını tamamıyla çözdüm. Geriye açı, torsion filan kaldı ama bağ kısmını hallettikten sonra pek bir sorun çıkaracaklarını sanmam. HyperChem, daha evvel bahsettiğim üzere, bütün hesap yöntemlerini dürüstçe açıklamış ama uygulama aşamasına geçince, aslında hiç de yaptıklarını söyledikleri şekilde yapmadıklarını hüsranla fark edip, tersten giderek formüllerine ulaştım. Şu güzellere bir bakın derim:

biraz bozuk bir grafit
HyperChem:
Single Point, MolecularMechanics, molecule = D:\cpp\depo\graphite.ent.
mmplus
Default parameters being used for torsions…
Default parameters being used for stretches…
Default parameters being used for van der Waals…
Default parameters being used for bends…
Total Energy=7339.045898 Gradient=128.656143.
Bond=7339.05 Angle=0 Dihedral=0 Vdw=0 Stretch-bend=0 Electrostatic=0.

Benim Program:[…]
599 – 598 Enerji –> 2.560039
Mesafe: 1.535771
Mesafe-l0: 0.035771
mmswitch = 1.000000
mms parantez : 0.928458
600 – 599 Enerji –> 0.427327

EBAG = 7339.047413 | EANG = 0.000000 | EVDW = 0.000000 | ESTB = 0.000000
TOPLAM = 7339.047413
GRAD = 0.000000

epey rastlantısal bir yapı

epey rastlantısal bir yapı
HyperChem:
Single Point, MolecularMechanics, molecule = D:\cpp\depo\sil.ent.
mmplus
Default parameters being used for torsions…
Default parameters being used for stretches…
Default parameters being used for van der Waals…
Default parameters being used for bends…
Total Energy=110841.625000 Gradient=2234.989502.
Bond=110842 Angle=0 Dihedral=0 Vdw=0 Stretch-bend=0 Electrostatic=0.

Benim Program:
18 – 17 Enerji –> 7.701890
Mesafe: 1.789839
Mesafe-l0: 0.249839
mmswitch = 0.926193
mms parantez : 0.537201
19 – 18 Enerji –> 12.061432

EBAG = 110841.625965 | EANG = 0.000000 | EVDW = 0.000000 | ESTB = 0.000000
TOPLAM = 110841.625965 GRAD = 0.000000

yorgunlukta hatırlanan sıcak bir şey

Dün HyperChem’in iki karbon atomunun aralarındaki bağdan kaynaklanan enerjisini nasıl hesapladığını bulmaya çalışıyordum ve sonra ortaya çıktı ki -reverse engineering-, aslında söyledikleri gibi hesaplamıyormuş program. Bugün de sabahtan akşama bir üç komşusu olan karbon atomuyla, iki komşulu bir karbon atomunun bağ etkileşim enerjisinin formülünü bulmaya çalıştım, durum bir ara bayağı ümitsizleştiyse de, mutlu sona ulaştım (ve yine yaptıklarını söyledikleri şekilde değildi aslında yaptıkları). Neyse, asıl demek istediğim, yorgunluktan kapaklanmak üzere olduğum şu saniyelerde, aklıma Catalina’nın Earl için dans etmesi geldi. Catalina kim, Earl neci, bilmiyorsanız da boşverin, bilenler bilir.. 8)